José Luis Morales jugó en el CD Logroñés a finales de los años 90 durante tres temporadas: la última del equipo en Primera División (1996-1997) y las dos siguientes (1997-1999). Antes de ello, estuvo enrolado en las filas del RCD Mallorca, cedido por el Real Sporting de Gijón y, el 17 de marzo de 1996, tal día como hoy hace 26 años, visitó Las Gaunas para enfrentarse al Logroñés (2-2) en la jornada 29 de la Liga de Segunda.